上海伯杰生物科技有限公司   
Shanghai Bio-Germ Biological Technology Co.,Ltd

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病毒全基因组测序和分析技术
一代测序(Sanger测序)

        本公司独立研发设计了针对常见流感病毒亚型(甲型H1N1、H3N2、乙型-Yamagata谱系、乙型-Victoria谱系)病毒全基因组和禽流感(H5N1、H7N9)以及手足口病毒(EV71、CA16、CA10、CA6)的病毒全基因测序引物。可以承担PCR扩增、测序和数据分析三个步骤。测序平台为ABI3730XL,测序时限为接样后2周。 

 

二代测序(高通量测序)

        病毒宏基因组学(二代测序获取病毒基因组并进行相关数据分析)是本公司在病毒测序领域的独特技术。本公司研发团队成员中,有2位骨干专家掌握病毒宏基因组学核心技术,该专家有近10年从事病毒宏基因组学技术应用和研究的工作经验,建立了成熟的病毒宏基因组学分析平台。可以对包含有痕量病毒的环境标本(污水、环境涂抹样、正常水体)、背景干扰较大的来源于人体或其他哺乳动物、海洋生物的病毒标本(咽拭子、痰液、粪便、血液标本)以及纯培养的病毒株进行全基因组的二代测序。

        该平台通过样品的特殊处理、痕量病毒基因文库的构建、深度测序和生物信息学分析等过程,大大提高样品中病毒核酸检测灵敏度和病毒全基因组覆盖率,使高通量测序结果中病毒序列占比高于10%(目前国内外其它研究机构和类似公司获得的该比例仅为不到1%)。纯培养病毒株的测序数据在8G以上,环境痕量病毒测序数据在4-6G。测序使用平台为Illumina的Miseq。测序和数据分析时限为接样后一个月。可以承接紧急样本。

 

目 录 号

产   品   名   称

病毒一代全基因测序

 

FW-CX-001

甲型流感病毒H1N1型

FW-CX-002

甲型流感病毒H3N2型

FW-CX-003

乙型流感病毒Yamagata亚型

FW-CX-004

乙型流感病毒Victoria亚型

FW-CX-005

禽流感病毒H5N1型

FW-CX-006

禽流感病毒H7N9型

FW-CX-007

禽流感病毒H9N2型

FW-CX-008

肠道病毒EV71型

FW-CX-009

柯萨奇病毒CA6型

FW-CX-010

柯萨奇病毒CA10型

FW-CX-012

柯萨奇病毒CA16型

FW-CX-013

诺如病毒

病毒二代全基因测序

 

FW-CX-201

病毒全基因二代测序

一代测序

 

FW-CX-101

PCR产物一代测序

FW-CX-102

甲型流感病毒H1型HA全长基因测序

FW-CX-103

甲型流感病毒H1型NA全长基因测序

FW-CX-104

甲型流感病毒H1N1型HA全长基因测序

FW-CX-105

甲型流感病毒H1N1型NA全长基因测序

FW-CX-106

甲型流感病毒H3型HA全长基因测序

FW-CX-107

甲型流感病毒H3型NA全长基因测序

FW-CX-108

乙型流感病毒HA全长基因测序

FW-CX-109

乙型流感病毒NA全长基因测序

FW-CX-110

禽流感病毒H7N9型HA全长基因测序

FW-CX-111

禽流感病毒H7N9型NA全长基因测序

其他技术服务

 

FW-QT-001

荧光定量PCR技术

FW-QT-002

引物合成服务

FW-QT-003

探针合成服务

FW-QT-004

MGB探针

FW-QT-005

基因合成服务

FW-QT-006

克隆服务

FW-QT-007

焦磷酸测序

FW-QT-008

病毒核酸提取(进口)

FW-QT-009

病毒核酸提取(国产)

FW-QT-010

细菌核酸提取

FW-QT-011

PCR扩增(含逆转录)

FW-QT-012

PCR扩增

病毒全基因组测序和分析技术

一代测序(Sanger测序)

        本公司独立研发设计了针对常见流感病毒亚型(甲型H1N1、H3N2、乙型-Yamagata谱系、乙型-Victoria谱系)病毒全基因组和禽流感(H5N1、H7N9)以及手足口病毒(EV71、CA16、CA10、CA6)的病毒全基因测序引物。可以承担PCR扩增、测序和数据分析三个步骤。测序平台为ABI3730XL,测序时限为接样后2周。 

 

二代测序(高通量测序)

        病毒宏基因组学(二代测序获取病毒基因组并进行相关数据分析)是本公司在病毒测序领域的独特技术。本公司研发团队成员中,有2位骨干专家掌握病毒宏基因组学核心技术,该专家有近10年从事病毒宏基因组学技术应用和研究的工作经验,建立了成熟的病毒宏基因组学分析平台。可以对包含有痕量病毒的环境标本(污水、环境涂抹样、正常水体)、背景干扰较大的来源于人体或其他哺乳动物、海洋生物的病毒标本(咽拭子、痰液、粪便、血液标本)以及纯培养的病毒株进行全基因组的二代测序。

        该平台通过样品的特殊处理、痕量病毒基因文库的构建、深度测序和生物信息学分析等过程,大大提高样品中病毒核酸检测灵敏度和病毒全基因组覆盖率,使高通量测序结果中病毒序列占比高于10%(目前国内外其它研究机构和类似公司获得的该比例仅为不到1%)。纯培养病毒株的测序数据在8G以上,环境痕量病毒测序数据在4-6G。测序使用平台为Illumina的Miseq。测序和数据分析时限为接样后一个月。可以承接紧急样本。

目 录 号 产   品   名   称
病毒一代全基因测序  
FW-CX-001 甲型流感病毒H1N1型
FW-CX-002 甲型流感病毒H3N2型
FW-CX-003 乙型流感病毒Yamagata亚型
FW-CX-004 乙型流感病毒Victoria亚型
FW-CX-005 禽流感病毒H5N1型
FW-CX-006 禽流感病毒H7N9型
FW-CX-007 禽流感病毒H9N2型
FW-CX-008 肠道病毒EV71型
FW-CX-009 柯萨奇病毒CA6型
FW-CX-010 柯萨奇病毒CA10型
FW-CX-012 柯萨奇病毒CA16型
FW-CX-013 诺如病毒
病毒二代全基因测序  
FW-CX-201 病毒全基因二代测序
一代测序  
FW-CX-101 PCR产物一代测序
FW-CX-102 甲型流感病毒H1型HA全长基因测序
FW-CX-103 甲型流感病毒H1型NA全长基因测序
FW-CX-104 甲型流感病毒H1N1型HA全长基因测序
FW-CX-105 甲型流感病毒H1N1型NA全长基因测序
FW-CX-106 甲型流感病毒H3型HA全长基因测序
FW-CX-107 甲型流感病毒H3型NA全长基因测序
FW-CX-108 乙型流感病毒HA全长基因测序
FW-CX-109 乙型流感病毒NA全长基因测序
FW-CX-110 禽流感病毒H7N9型HA全长基因测序
FW-CX-111 禽流感病毒H7N9型NA全长基因测序
其他技术服务  
FW-QT-001 荧光定量PCR技术
FW-QT-002 引物合成服务(2OD)
FW-QT-003 探针合成服务(2OD)
FW-QT-004 MGB探针(2OD)
FW-QT-005 基因合成服务(<3000bp)
FW-QT-006 克隆服务(<1300bp)
FW-QT-007 焦磷酸测序
FW-QT-008 病毒核酸提取(进口)
FW-QT-009 病毒核酸提取(国产)
FW-QT-010 细菌核酸提取
FW-QT-011 PCR扩增(含逆转录)
FW-QT-012 PCR扩增
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